36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0809 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0809  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
80 aa  156  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0398  iron-sulfur cluster-binding protein  52.5 
 
 
80 aa  88.6  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.274807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1840  ferredoxin  38.03 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2146  iron-sulfur cluster-binding protein  32.88 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.471732  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0917  hypothetical protein  31.43 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542484  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  30.14 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0733  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  32.05 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.08 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2123  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
337 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.51 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.712445  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 
344 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.66 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
343 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
343 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0910  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00418266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  32.86 
 
 
352 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1431  NIL domain protein  32.43 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000290887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  25.97 
 
 
134 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  31.43 
 
 
344 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.77 
 
 
147 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  30 
 
 
344 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.29 
 
 
343 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1505  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.63 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.57 
 
 
344 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  34.43 
 
 
339 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  29.17 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>