52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1228 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  65.78 
 
 
227 aa  301  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  53.33 
 
 
229 aa  224  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  47.64 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  45.37 
 
 
230 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  44.49 
 
 
230 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  48.18 
 
 
233 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  46.02 
 
 
231 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  45.26 
 
 
235 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  46.8 
 
 
231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  44.83 
 
 
235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  44.4 
 
 
235 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  44.4 
 
 
235 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  44.4 
 
 
235 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  44 
 
 
229 aa  192  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  47.79 
 
 
235 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  45.21 
 
 
231 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  44.4 
 
 
235 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  44.21 
 
 
235 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  44.64 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  43.35 
 
 
235 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  43.53 
 
 
235 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  44.21 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  44.78 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  44.78 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  44.25 
 
 
229 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  45.64 
 
 
225 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  45.64 
 
 
225 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  37.56 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  36.16 
 
 
234 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  37.33 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  36.52 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  39.89 
 
 
243 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  34.78 
 
 
229 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  34.33 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  38.92 
 
 
265 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  36.56 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  33.33 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  35.91 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  31.9 
 
 
229 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  33.18 
 
 
251 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  37.74 
 
 
256 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  39.73 
 
 
234 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  30.14 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  28.89 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  31.7 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  29.6 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  28.06 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  28.43 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  29 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  32.45 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  24.85 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>