19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3810 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3810  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3151  OmpA domain-containing protein  90.3 
 
 		 167 aa  303  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0816  OmpA domain-containing protein  90.3 
 
 		 167 aa  303  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3527  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  77.01 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0715  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  76.47 
 
 		 187 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3596  OmpA domain-containing protein  76.47 
 
 		 187 aa  300  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.863386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0787  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  89.09 
 
 		 167 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3719  OmpA domain-containing protein  75.94 
 
 		 187 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0823  OmpA domain-containing protein  72.77 
 
 		 191 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.961285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3630  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  47.37 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3437  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  47.54 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  45.11 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3640  OmpA domain-containing protein  48.68 
 
 		 190 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.750133  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000761  OmpA-like transmembrane domain protein  40 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04884  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3816  OmpA domain-containing protein  32.16 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.549731  normal  0.0255224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0698  hypothetical protein  27.03 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  28.84 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  27.4 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>