15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1717 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2566  hypothetical protein  84.58 
 
 		 200 aa  349  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2633  hypothetical protein  83.58 
 
 		 200 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2741  hypothetical protein  82.09 
 
 		 200 aa  339  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1561  hypothetical protein  63.59 
 
 		 239 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.296774  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1532  hypothetical protein  63.59 
 
 		 239 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1528  hypothetical protein  63.08 
 
 		 239 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2823  hypothetical protein  63.08 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3179  hypothetical protein  44.17 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.860412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1494  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2753  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1686  hypothetical protein  35.42 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2211  putative lipoprotein  34.68 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3122  lipoprotein  24.02 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.733672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0967  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>