15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1789 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1789  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  236  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0393743  normal  0.306376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1791  hypothetical protein  99.11 
 
 
112 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1851  hypothetical protein  98.21 
 
 
112 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1666  hypothetical protein  98.21 
 
 
112 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0750434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1485  hypothetical protein  98.21 
 
 
112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.239267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  38.32 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  34.44 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  34.44 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  32.04 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  32.04 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  32.41 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  34.44 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4641  hypothetical protein  27.85 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>