31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1308 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1308  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1839  hypothetical protein  89.73 
 
 		 263 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1804  hypothetical protein  89.73 
 
 		 263 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2750  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3364  aminoglycoside phosphotransferase  45.91 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0682  aminoglycoside phosphotransferase  50.19 
 
 		 260 aa  254  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4843  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4818  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4835  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.515713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4952  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4596  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4433  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4451  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4813  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.79 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4532  aminoglycoside phosphotransferase  44.02 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0423  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.02 
 
 		 265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0792  choline kinase  29.17 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000389702  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0375  hypothetical protein  29.95 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1570  hypothetical protein  30.41 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00112877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0921  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2527  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  27.93 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2632  aminoglycoside phosphotransferase  43.9 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  24.31 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  38.6 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0395  aminoglycoside phosphotransferase  27.41 
 
 		 411 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1626  aminoglycoside phosphotransferase  23.01 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 		 357 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>