128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2065 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2065  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
50 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0261  50S ribosomal protein L33  88 
 
 
50 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000634475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0353  50S ribosomal protein L33  66 
 
 
49 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2408  50S ribosomal protein L33  61.7 
 
 
49 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00953034  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0112  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 
53 aa  57.8  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0266  ribosomal protein L33  52 
 
 
59 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0327529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  52.17 
 
 
49 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl089  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  52.17 
 
 
49 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  51.11 
 
 
49 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
52 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
49 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  51.11 
 
 
49 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  53.9  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 
49 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
49 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  44 
 
 
50 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 
49 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  44 
 
 
50 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0687  50S ribosomal protein L33  52.27 
 
 
49 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  48.21 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
49 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  44.44 
 
 
54 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 
48 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0091  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 
49 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  50 
 
 
49 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  46.67 
 
 
49 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  52.17 
 
 
54 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
48 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
48 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
48 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
56 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  50 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  44.44 
 
 
49 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  45.65 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  52.27 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  45.45 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 
56 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  40.91 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  43.18 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0612  50S ribosomal protein L33  43.18 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0833  50S ribosomal protein L33P  45.24 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169832  normal  0.0907475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0666  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
56 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  48.89 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  43.48 
 
 
49 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  45.45 
 
 
49 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  44.44 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  43.18 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1054  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.185185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
55 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 
56 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 
56 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
49 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  39.58 
 
 
49 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
49 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
54 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  38.64 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  38.64 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  45.65 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  45.45 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  36.96 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  45.65 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf096  ribosomal protein L33  48.94 
 
 
48 aa  45.1  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  43.48 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>