122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2408 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2408  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
49 aa  99.8  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00953034  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2065  50S ribosomal protein L33  61.7 
 
 
50 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0261  50S ribosomal protein L33  59.57 
 
 
50 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000634475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0353  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 
49 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225254 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl089  50S ribosomal protein L33  59.57 
 
 
54 aa  61.2  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0112  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 
53 aa  60.5  0.000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0266  ribosomal protein L33  60.87 
 
 
59 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0327529  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  53.49 
 
 
49 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
48 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
48 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
48 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
48 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  51.16 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  53.49 
 
 
49 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0091  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  51.16 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  46.51 
 
 
54 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  53.49 
 
 
49 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  48.98 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
55 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  50 
 
 
54 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  48.84 
 
 
49 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
52 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
56 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  48.84 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  48.84 
 
 
55 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  45.65 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0095  ribosomal protein L33  46 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000218198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 
56 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
55 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
49 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  44.19 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 
56 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0687  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 
49 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf096  ribosomal protein L33  46.81 
 
 
48 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  45.65 
 
 
56 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  41.3 
 
 
54 aa  44.3  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1054  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
49 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.185185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  43.48 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
49 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  43.48 
 
 
55 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0612  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2349  ribosomal protein L33  44.19 
 
 
49 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0078385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  41.86 
 
 
49 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  45.65 
 
 
54 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0557  50S ribosomal protein L33  39.58 
 
 
47 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0127832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0571  50S ribosomal protein L33  39.58 
 
 
47 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  43.48 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  42.86 
 
 
52 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  38.64 
 
 
55 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  43.48 
 
 
54 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  38.64 
 
 
55 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  38.64 
 
 
55 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0850  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0666  50S ribosomal protein L33  46.51 
 
 
49 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
52 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  44.19 
 
 
49 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>