75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf096 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf096  ribosomal protein L33  100 
 
 
48 aa  96.3  1e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0353  50S ribosomal protein L33  60.87 
 
 
49 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225254 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl089  50S ribosomal protein L33  58 
 
 
54 aa  54.3  0.0000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0112  50S ribosomal protein L33  59.57 
 
 
53 aa  51.2  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 
48 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  52.17 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0266  ribosomal protein L33  44.68 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0327529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 
54 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  54.35 
 
 
55 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 
55 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 
55 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  50 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 
55 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  52.17 
 
 
54 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  53.33 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  56.52 
 
 
49 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  50 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0095  ribosomal protein L33  53.19 
 
 
49 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000218198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2065  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 
50 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  54.55 
 
 
54 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2408  50S ribosomal protein L33  46.81 
 
 
49 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00953034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
49 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  52.17 
 
 
49 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  52.17 
 
 
49 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  43.9  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  48.89 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  42.22 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  54.55 
 
 
54 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
49 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0261  50S ribosomal protein L33  51.06 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000634475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  50 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  46.67 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  46.67 
 
 
49 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  52.27 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  42.22 
 
 
49 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  48.89 
 
 
49 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 
49 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  46.51 
 
 
54 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 
49 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  48.84 
 
 
49 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 
49 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 
54 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  44.44 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  47.83 
 
 
56 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 
54 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0557  50S ribosomal protein L33  43.48 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0127832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0571  50S ribosomal protein L33  43.48 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 
49 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  42.22 
 
 
49 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
49 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
49 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 
55 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0091  50S ribosomal protein L33  42.55 
 
 
49 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  43.48 
 
 
55 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  46.15 
 
 
64 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.161899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>