13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4106 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_7359  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 489 bp  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4106    100 
 
 		 105 bp  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.412699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  94.06 
 
 		 822 bp  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3776    95.65 
 
 		 823 bp  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0616    84.78 
 
 		 860 bp  71.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0752    84.78 
 
 		 860 bp  71.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.874544  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3534    84.78 
 
 		 860 bp  71.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3184    84.09 
 
 		 860 bp  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3739    84.09 
 
 		 860 bp  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  86.96 
 
 		 822 bp  44.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  86.96 
 
 		 870 bp  44.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  86.96 
 
 		 453 bp  44.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 609 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>