28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0724 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  80.65 
 
 		 231 aa  357  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  43.12 
 
 		 266 aa  184  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  29.65 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  28.7 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  29.93 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  27.16 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  28.5 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  25.71 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  28.65 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  25.71 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  25.25 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  25.97 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  26.83 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  26.11 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  24.38 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  28.36 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  25.39 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  27.86 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  24.77 
 
 		 288 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  26.24 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  26.24 
 
 		 333 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.42 
 
 		 324 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>