24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3739 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  95.25 
 
 		 512 aa  950    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1022    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  53.04 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  47.91 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  47.7 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  49.9 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  51.58 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  47.9 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  39.5 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  37.05 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  37.73 
 
 		 513 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  37.53 
 
 		 513 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  38.28 
 
 		 512 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  39.96 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  34.47 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  26.71 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  24.12 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  24.15 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  24.04 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  36.27 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  30 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0843  hypothetical protein  27.73 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0826  hypothetical protein  27.73 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  26.35 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>