27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3652 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3652  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0991597 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3940  hypothetical protein  58.05 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2844  sugar isomerase (SIS)  41.38 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3956  sugar isomerase (SIS)  39.01 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612193  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3641  hypothetical protein  39.22 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.511094  normal  0.47359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4895  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.8 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4954  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.8 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.28349  normal  0.604519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4948  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.8 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4794  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.8 
 
 		 336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.985432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0297  sugar isomerase (SIS)  28.32 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0625  sugar isomerase  23.62 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0684  sugar isomerase  23.62 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9146  yurP  24.73 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19979  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5462  sugar isomerase (SIS)  24.83 
 
 		 333 aa  89  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3473  sugar isomerase (SIS)  21.83 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4683  fructoselysine-6-P-deglycase  26.32 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.791225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3841  fructoselysine-6-P-deglycase  25.63 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3567  fructoselysine-6-P-deglycase  25.63 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0341  fructoselysine-6-P-deglycase  25.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.782392  normal  0.312145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0341  sugar isomerase (SIS)  25.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03174  hypothetical protein  25.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03222  fructoselysine-6-P-deglycase  25.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3976  sugar isomerase  20.6 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3915  sugar isomerase  20.6 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3795  sugar isomerase  20.6 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.911401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3807  sugar isomerase  20.6 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3873  sugar isomerase  20.6 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>