29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3370 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3370  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.485584  normal  0.945167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0501  HupG hydrogenase expression/formation protein  81.6 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2152  hydrogenase-1 expression HyaE  81.6 
 
 		 128 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.136695  normal  0.199969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3103  hydrogenase-1 expression HyaE  68.33 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50540  hydrogenase expression/formation protein, HoxO  41.67 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2178  hydrogenase-1 expression HyaE  37.6 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112177  normal  0.189005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2024  hydrogenase-1 expression HyaE  35 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.328634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2820  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1969  hydrogenase-1 expression HyaE  35.54 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1291  hydrogenase-1 expression HyaE  33.88 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000102865  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7260  hydrogenase-1 expression HyaE  47.3 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352807  normal  0.532049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3984  hydrogenase-1 expression HyaE  31.03 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1168  hydrogenase-1 expression HyaE  45.45 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0334  hydrogenase-1 expression HyaE  35.96 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00191534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1155  hydrogenase-1 expression HyaE  30.95 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2001  hydrogenase expression/formation  34.23 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1802  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  26.74 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0548296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1637  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  26.74 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1646  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  26.74 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.769787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1638  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  26.74 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1705  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  25.58 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1160  hydrogenase-1 expression HyaE  37.76 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0717414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1988  hydrogenase-1 operon protein HyaE  30.25 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3767  hydrogenase-1 expression HyaE  37.96 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1928  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.48 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1344  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.48 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1528  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.48 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.325234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1932  hydrogenase-1 operon protein HyaE  30.56 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 489 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>