24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1245 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  553  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  86.64 
 
 		 276 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  87.36 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  49.04 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  43.98 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  44.81 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  49.61 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  45.35 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  49.01 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  44.13 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  44.48 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  42.76 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  42.96 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  42.81 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  39.46 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  39.46 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  42.7 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  43.17 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  42.61 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  38.85 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  25.99 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  28.39 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  28.85 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  25.75 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>