27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2131 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2131  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0296794  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  87.23 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  66.67 
 
 		 399 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  66.67 
 
 		 399 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  64.91 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  64.91 
 
 		 399 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  64.91 
 
 		 399 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  63.16 
 
 		 399 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  56.72 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  64.91 
 
 		 399 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  64.91 
 
 		 399 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  64.91 
 
 		 399 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  63.16 
 
 		 337 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  57.89 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  57.89 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  63.16 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  60.34 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  60.34 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  46.03 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  47.54 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  47.54 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  47.54 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  47.54 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  45.61 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  41.79 
 
 		 415 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  41.79 
 
 		 415 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  40.3 
 
 		 414 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>