45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1266 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1266  photosystem I assembly BtpA  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2112  photosystem I assembly BtpA  55.95 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.348808  normal  0.986684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3749  photosystem I assembly BtpA  48.03 
 
 		 272 aa  235  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3697  photosystem I assembly BtpA  48.82 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04130  hypothetical protein  48.82 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04168  predicted nucleoside triphosphatase  48.82 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2619  photosystem I assembly BtpA  48 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.509941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3780  photosystem I assembly BtpA  46.4 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.579042  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1793  hypothetical protein  47.24 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.380259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1546  hypothetical protein  46.85 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1732  hypothetical protein  46.85 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1729  hypothetical protein  46.85 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1727  hypothetical protein  46.85 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19381  normal  0.3665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2468  photosystem I assembly BtpA  42.13 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2423  photosystem I assembly BtpA  42.13 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2462  photosystem I assembly BtpA  42.13 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3686  photosystem I assembly BtpA  42.8 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3314  photosystem I assembly BtpA  40.62 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2513  photosystem I assembly BtpA  31.89 
 
 		 294 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.145919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3523  photosystem I assembly BtpA  35.16 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1521  photosystem I assembly BtpA  35.14 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0640  photosystem I assembly BtpA  31.25 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4795  photosystem I assembly BtpA  30.2 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0235  photosystem I assembly BtpA  30.56 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.569155  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0541  photosystem I assembly BtpA  33.07 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3089  photosystem I assembly BtpA  30.74 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1136  photosystem I assembly BtpA  31.8 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0171957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3031  photosystem I assembly BtpA  30.74 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6166  photosystem I assembly BtpA  30.3 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000474766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0445  photosystem I assembly BtpA  29.69 
 
 		 282 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2015  photosystem I assembly BtpA  30.62 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1082  photosystem I assembly BtpA  31.02 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7481  hypothetical protein  29.84 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0069483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3868  photosystem I assembly BtpA  31.52 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2116  photosystem I assembly BtpA  34.75 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3693  BtpA protein  29.06 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0469  photosystem I assembly BtpA  28.17 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3428  photosystem I assembly BtpA  28.29 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1474  photosystem I assembly BtpA  27.1 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2153  photosystem I assembly BtpA  29.3 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0929  photosystem I assembly BtpA  28.16 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.28389  normal  0.101264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0889  photosystem I assembly BtpA  28 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1621  photosystem I assembly BtpA  27.54 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.123371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1972  photosystem I assembly BtpA  25 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  29.13 
 
 		 289 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>