16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0184 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1109    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  25.57 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1149  hypothetical protein  27.42 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0538158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  23.4 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  25.09 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  38.46 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  29.94 
 
 		 299 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  24.87 
 
 		 513 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  22.69 
 
 		 279 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  29.65 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  26.32 
 
 		 298 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  28.33 
 
 		 274 aa  48.9  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  25.12 
 
 		 338 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.49 
 
 		 280 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  24.83 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  28.64 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>