20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4876 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  85.22 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  80.7 
 
 		 113 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  82.61 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  82.61 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  71.72 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  65.77 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  58.68 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  73.27 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  57.41 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  66.37 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  57 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  51.75 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  54.63 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  61.05 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  58.82 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  46.79 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  32.56 
 
 		 107 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  29.03 
 
 		 111 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>