13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2303 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2303  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1472    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4443  hypothetical protein  34 
 
 		 672 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 673 aa  287  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0310  hypothetical protein  24.5 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0639  portal protein  27.54 
 
 		 725 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.308579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0401  portal protein  27.09 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000565323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3003  hypothetical protein  24.39 
 
 		 690 aa  108  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0386  hypothetical protein  22.03 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5695  hypothetical protein  20.17 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2355  hypothetical protein  25.53 
 
 		 779 aa  50.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512259  unclonable  0.0000000418473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3865  hypothetical protein  30.67 
 
 		 261 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3058  hypothetical protein  22.16 
 
 		 734 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500224  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0228  hypothetical protein  24.19 
 
 		 628 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>