18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2064 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2064  integral membrane protein  100 
 
 		 653 aa  1321    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0863025  normal  0.971709 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0064  traY protein  32.54 
 
 		 714 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0084  integral membrane protein  31.11 
 
 		 722 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.421711  normal  0.537014 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0069  traY protein  31.75 
 
 		 714 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1685  hypothetical protein  26.13 
 
 		 665 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155635  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2827  putative TraY/DotA-like type IV secretion system protein  26.73 
 
 		 751 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3946  hypothetical protein  27.22 
 
 		 972 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0988  hypothetical protein  24.46 
 
 		 770 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5350  hypothetical protein  23.34 
 
 		 960 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3854  hypothetical protein  23.47 
 
 		 776 aa  107  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1097  hypothetical protein  22.26 
 
 		 842 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.361233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1846  DotA protein  21.71 
 
 		 806 aa  81.3  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0348  DotA  21.95 
 
 		 814 aa  81.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4275  hypothetical protein  28.02 
 
 		 880 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2613  defect in organelle trafficking protein DotA  28.46 
 
 		 1047 aa  71.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5612  hypothetical protein  22.3 
 
 		 752 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.167609 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0097  type IV secretion system protein DotA-like protein  21.17 
 
 		 840 aa  67.4  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2740  defect in organelle trafficking protein DotA  37.61 
 
 		 1035 aa  60.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>