32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2852 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2852  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2578  hypothetical protein  80.6 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  decreased coverage  0.0015233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2893  hypothetical protein  68.95 
 
 		 276 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1827  hypothetical protein  60.75 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1435  hypothetical protein  51.34 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2569  hypothetical protein  63.64 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3946  hypothetical protein  51.47 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5238  hypothetical protein  67.53 
 
 		 201 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5879  hypothetical protein  72.06 
 
 		 191 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6496  hypothetical protein  73.53 
 
 		 181 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5431  hypothetical protein  79.37 
 
 		 183 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4695  hypothetical protein  57.28 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5160  hypothetical protein  59.34 
 
 		 198 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2242  hypothetical protein  34.96 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1673  hypothetical protein  31.89 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1570  hypothetical protein  32.52 
 
 		 203 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2684  hypothetical protein  52.86 
 
 		 307 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4236  hypothetical protein  56.52 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333237  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3005  hypothetical protein  36.78 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1150  hypothetical protein  58.62 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2149  hypothetical protein  55.17 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1004  hypothetical protein  35.09 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1689  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1724  hypothetical protein  46.77 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0136792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1797  hypothetical protein  42.47 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1782  hypothetical protein  51.72 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0185  hypothetical protein  47.92 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2263  hypothetical protein  55.81 
 
 		 141 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1095  hypothetical protein  55.26 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22 
 
 		 2449 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>