32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1673 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1673  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1474  hypothetical protein  86.82 
 
 
294 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.656718  normal  0.108211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2684  hypothetical protein  41.77 
 
 
307 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1150  hypothetical protein  43.05 
 
 
260 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2242  hypothetical protein  57.97 
 
 
259 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0939  hypothetical protein  57.97 
 
 
243 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0946  hypothetical protein  57.97 
 
 
243 aa  85.5  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1570  hypothetical protein  56.72 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5160  hypothetical protein  48.28 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6496  hypothetical protein  58.21 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4695  hypothetical protein  47.13 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5879  hypothetical protein  55.22 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2578  hypothetical protein  49.32 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  decreased coverage  0.0015233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2569  hypothetical protein  48.57 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1827  hypothetical protein  43.48 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2893  hypothetical protein  55.17 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5238  hypothetical protein  45.12 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1435  hypothetical protein  47.76 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5431  hypothetical protein  55.17 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0464823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3946  hypothetical protein  51.72 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3005  hypothetical protein  75 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1724  hypothetical protein  69.44 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0136792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2149  hypothetical protein  40.26 
 
 
179 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1004  hypothetical protein  41.46 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1689  hypothetical protein  63.89 
 
 
154 aa  52.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2263  hypothetical protein  57.89 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.637535  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0185  hypothetical protein  52.38 
 
 
145 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1782  hypothetical protein  48.65 
 
 
185 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1797  hypothetical protein  47.37 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0686  hypothetical protein  48.72 
 
 
191 aa  45.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000452039  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0653  hypothetical protein  48.72 
 
 
191 aa  45.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000874284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1095  hypothetical protein  50 
 
 
183 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.864147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>