19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0657 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6273  hypothetical protein  42.62 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2625  hypothetical protein  41.88 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6985  hypothetical protein  42.67 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4247  hypothetical protein  43.42 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4092  hypothetical protein  42.98 
 
 		 225 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1911  hypothetical protein  41.96 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1849  methyltransferase small  43.44 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0521  hypothetical protein  39.21 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3567  hypothetical protein  39.52 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  32.75 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  31.58 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0325  hypothetical protein  26.64 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000884213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01959  hypothetical protein  31.11 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6173  hypothetical protein  29.22 
 
 		 591 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  26.52 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  26.47 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0792  hypothetical protein  26.92 
 
 		 173 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207643 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  26.47 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>