78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0350 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0350  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  100 
 
 		 610 aa  1241    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0377  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  83.72 
 
 		 606 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.653726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0473  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  85.26 
 
 		 605 aa  974    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1419  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  31.08 
 
 		 573 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46450  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  31.54 
 
 		 577 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527502  hitchhiker  0.000135384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4009  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  31.72 
 
 		 577 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4565  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  30.31 
 
 		 571 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1324  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  30.31 
 
 		 571 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1792  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  31.15 
 
 		 572 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4204  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.72 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000159244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4077  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  30.31 
 
 		 569 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3866  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  29.84 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.456755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2553  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.87 
 
 		 589 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0481242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1775  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  29.28 
 
 		 575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4501  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.25 
 
 		 584 aa  210  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.746712  normal  0.0262153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0366  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  29.75 
 
 		 612 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0296  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  29.58 
 
 		 575 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3925  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  29.58 
 
 		 575 aa  204  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0379  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.86 
 
 		 605 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28205  normal  0.397547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3956  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.47 
 
 		 588 aa  203  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2039  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.88 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1924  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.64 
 
 		 584 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0136  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.8 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0136  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.97 
 
 		 611 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2838  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.01 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3368  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.38 
 
 		 618 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0128  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.97 
 
 		 611 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2926  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.52 
 
 		 605 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0278  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.18 
 
 		 608 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.092506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2312  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.52 
 
 		 605 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2941  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.52 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3840  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.77 
 
 		 615 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0104  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.63 
 
 		 607 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3777  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.44 
 
 		 591 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2279  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0094  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3087  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2008  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0398  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0419  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0581  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.23 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1260  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.34 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0346  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.05 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1118  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.33 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03338  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.73 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4733  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.92 
 
 		 606 aa  193  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2975  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.58 
 
 		 622 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6269  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.67 
 
 		 619 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0758  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.05 
 
 		 577 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4188  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.88 
 
 		 625 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3055  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.49 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3679  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.75 
 
 		 576 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0463  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.28 
 
 		 612 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3777  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.33 
 
 		 609 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.889891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5989  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.38 
 
 		 595 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4253  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.28 
 
 		 612 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875463  normal  0.269158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0367  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.8 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5487  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.51 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.959223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0220  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.07 
 
 		 573 aa  184  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0917006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1839  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  28.64 
 
 		 587 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4522  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.27 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4397  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.27 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4432  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.27 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0452  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.35 
 
 		 585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.23077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3121  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  24.41 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4369  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.91 
 
 		 602 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4519  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.4 
 
 		 583 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00978346  normal  0.188364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4470  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.16 
 
 		 574 aa  180  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.546627  normal  0.0898843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4595  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.1 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.434751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4251  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.33 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4561  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.33 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0180  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.21 
 
 		 602 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203871  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3981  (Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))) kinase  26.33 
 
 		 578 aa  177  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0457  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  25.89 
 
 		 623 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4014  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.33 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03848  hypothetical protein  26.33 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03888  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.33 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4511  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.03 
 
 		 578 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>