21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4281 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4281  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0938  hypothetical protein  79.65 
 
 		 174 aa  289  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.156043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0264  hypothetical protein  45.1 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  28.37 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.77 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.77 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  30.71 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  25.74 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 251 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  24.06 
 
 		 190 aa  44.3  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  38.81 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  26 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  22.86 
 
 		 244 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>