152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2813 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2813  OsmC family protein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2555  OsmC family protein  87.59 
 
 		 140 aa  245  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1268  OsmC-like protein protein  37.5 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  29.73 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  35.07 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  32.85 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  30.47 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5001  OsmC family protein  36.79 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000117697  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2834  OsmC family protein  34.91 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  32.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  32.54 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2780  OsmC family protein  36.11 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  30.37 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  31.3 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1405  OsmC family protein  33.9 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.969301  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2351  OsmC family protein  32 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0597  OsmC family protein  36.07 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  32.28 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  32.28 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0674  OsmC family protein  38.1 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.951893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  29.77 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  30.6 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  32.46 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  31.01 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  29.55 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  29.55 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  31.01 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  29.55 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  29.55 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  30.7 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  31.63 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  27.54 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  31.3 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  31.58 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1855  OsmC family protein  29.79 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  26.47 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1163  OsmC family protein  27.86 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  32.46 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  32.46 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  23.88 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4022  OsmC-like protein  31.01 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  32.14 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  30.77 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  29.82 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  29.01 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0861  OsmC family protein  31.15 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  30.17 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  28.07 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2244  OsmC-like protein  28.15 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.990359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  30.7 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  30.7 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  28.12 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  24.24 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0203  OsmC family protein  34.07 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0158527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0111  OsmC family protein  31.78 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  28.46 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3731  OsmC family protein  32.52 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.159888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  29.63 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  27.42 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  26.72 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  25.2 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  29.82 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1495  OsmC family protein  30.56 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  25.93 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3137  OsmC family protein  28.91 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565798  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06689  hypothetical protein  26.56 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  25.95 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  24.27 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1013  OsmC family protein  28.93 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000792  OsmC/Ohr family protein  28.03 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2738  OsmC-like protein  29.23 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1564  OsmC family protein  30.89 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  28.36 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2326  OsmC family protein  26.56 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0851  OsmC family protein  29.92 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  27.82 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  27.82 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0525  OsmC family protein  27.74 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  23.88 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>