14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1925 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1925  thiW protein  100 
 
 
174 aa  326  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4123  thiW protein  95.98 
 
 
174 aa  290  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2442  thiW protein  60.69 
 
 
171 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0147282  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1354  hypothetical protein  43.12 
 
 
163 aa  121  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.350585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1380  hypothetical protein  43.12 
 
 
163 aa  121  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0568  thiW protein  42.07 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000229686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2789  ThiW  50 
 
 
169 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0862  hypothetical protein  40.24 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1712  thiW protein  52.08 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2485  thiW protein  38.67 
 
 
171 aa  91.3  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0286  thiW protein  49.12 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.427336  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0937  hypothetical protein  43.14 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0835  hypothetical protein  39.66 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.768016  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1630  thiW protein  35.8 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.492516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>