19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1115 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3953  hypothetical protein  72.04 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.279999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  42.26 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  39.18 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  26.27 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  26.27 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1920  hypothetical protein  31.05 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0790  hypothetical protein  30.06 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  26.11 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  25.62 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  23.98 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  23.53 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  23.53 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2081  hypothetical protein  25.1 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1779  hypothetical protein  24.46 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.108191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>