12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1013 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 782 aa  1582    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3069  hypothetical protein  74.17 
 
 		 782 aa  1129    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  31.83 
 
 		 624 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  30.17 
 
 		 685 aa  193  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2994  Patatin  36.2 
 
 		 666 aa  183  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1993  putative suppressor  35.16 
 
 		 630 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2024  patatin  37.12 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0531  hypothetical protein  31.07 
 
 		 605 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0560  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  40.18 
 
 		 605 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5875  Patatin  29.77 
 
 		 646 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0563  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  55.66 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  42.65 
 
 		 332 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>