9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6307 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6307  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1520  hypothetical protein  43.06 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5185  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  43.06 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5611  hypothetical protein  42.04 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6504  hypothetical protein  39.1 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3708  hypothetical protein  27.7 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0451943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4229  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.776633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5010  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.26 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5415  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.26 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>