48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4434 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4434  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.823074  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4583  hypothetical protein  78.62 
 
 		 172 aa  263  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0097  hypothetical protein  25.66 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.284387  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1076  hypothetical protein  31.85 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3789  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3316  hypothetical protein  31.65 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2992  protein of unknown function DUF1697  40.28 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2258  protein of unknown function DUF1697  33.75 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3173  hypothetical protein  26.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0323444  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3366  hypothetical protein  26.14 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0461169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0516  hypothetical protein  25.81 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.260379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2030  protein of unknown function DUF1697  30.19 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0740176  hitchhiker  0.00584791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5447  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4791  protein of unknown function DUF1697  28.12 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4009  protein of unknown function DUF1697  36.11 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0709322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3895  protein of unknown function DUF1697  36.11 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.547846  normal  0.243704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2585  protein of unknown function DUF1697  29.94 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.643987  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0859  protein of unknown function DUF1697  31.82 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2046  protein of unknown function DUF1697  26.32 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4059  hypothetical protein  41.82 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4134  hypothetical protein  41.82 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.901726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0125  protein of unknown function DUF1697  32.61 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1268  protein of unknown function DUF1697  30.77 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0153  hypothetical protein  29.3 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4323  hypothetical protein  31.63 
 
 		 195 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4288  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1846  protein of unknown function DUF1697  24.84 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111817  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0986  protein of unknown function DUF1697  36.11 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2556  hypothetical protein  25.45 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1387  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0176326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2742  hypothetical protein  25.45 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.339272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2477  hypothetical protein  23.93 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1495  protein of unknown function DUF1697  28.1 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0351955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2750  hypothetical protein  25.45 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000420555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2548  hypothetical protein  28.12 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2349  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2927  hypothetical protein  25.97 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108096  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2754  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11178  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2570  protein of unknown function DUF1697  29.25 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2538  hypothetical protein  26.04 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000984258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1298  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1764  hypothetical protein  40.48 
 
 		 180 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2775  hypothetical protein  25.53 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000631538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2470  protein of unknown function DUF1697  29.59 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2796  hypothetical protein  26.53 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.255726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1652  protein of unknown function DUF1697  25.62 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0262317  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2140  protein of unknown function DUF1697  29.94 
 
 		 181 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>