20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3684 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3684  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5603  hypothetical protein  73.66 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2938  hypothetical protein  48.32 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0615  hypothetical protein  48.56 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1094  hypothetical protein  48.56 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000231967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1053  hypothetical protein  48.56 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0179968  normal  0.597638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2209  hypothetical protein  48.35 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0143217  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1046  hypothetical protein  47.9 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0802  hypothetical protein  47.48 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.142767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1689  hypothetical protein  47.06 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.046263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0970  hypothetical protein  49.17 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2774  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000030469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0974  hypothetical protein  49.17 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00597505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1831  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000164115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2881  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4207  hypothetical protein  48.35 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000627279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2507  hypothetical protein  46.64 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000108075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2820  hypothetical protein  46.64 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2936  hypothetical protein  46.64 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000867442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0505  hypothetical protein  46.64 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000746223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>