20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0974 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0974  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00597505  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0970  hypothetical protein  99.61 
 
 
258 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2209  hypothetical protein  91.86 
 
 
258 aa  460  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0143217  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4207  hypothetical protein  92.74 
 
 
260 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000627279  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1053  hypothetical protein  93.85 
 
 
260 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0179968  normal  0.597638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0615  hypothetical protein  93.85 
 
 
260 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1094  hypothetical protein  93.85 
 
 
260 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000231967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1689  hypothetical protein  84.5 
 
 
262 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.046263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2507  hypothetical protein  84.11 
 
 
262 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000108075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2774  hypothetical protein  84.11 
 
 
262 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000030469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2820  hypothetical protein  86.4 
 
 
300 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2881  hypothetical protein  84.11 
 
 
262 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1831  hypothetical protein  84.11 
 
 
262 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000164115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0505  hypothetical protein  86.4 
 
 
396 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000746223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2936  hypothetical protein  86.4 
 
 
448 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000867442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2938  hypothetical protein  86.25 
 
 
258 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1046  hypothetical protein  84.27 
 
 
258 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0802  hypothetical protein  86.67 
 
 
255 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.142767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3684  hypothetical protein  49.17 
 
 
250 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5603  hypothetical protein  45.04 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>