61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3135 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3135  cell division protein, FtsL -like protein  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293158  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2986  cell division protein, FtsL -like  86.52 
 
 
109 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2851  cell division FtsL transmembrane protein  81.4 
 
 
108 aa  143  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3096  cell division protein FtsL  77.91 
 
 
114 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2731  cell division protein FtsL  77.91 
 
 
114 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2680  cell division protein FtsL  57.14 
 
 
116 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0479  putative cell division transmembrane protein, FtsL  55.95 
 
 
116 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3477  cell division protein FtsL  50 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000038193  hitchhiker  0.00939757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0523  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1338  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0479  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3532  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3557  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3225  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0552  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0070  cell division protein, FtsL -like  53.57 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2843  cell division protein FtsL  48.96 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1111  cell division protein FtsL, putative  53.57 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3552  cell division protein FtsL  53.57 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2558  cell division protein FtsL, putative  53.57 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0456  cell division protein FtsL  48.96 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0481  cell division protein FtsL  48.96 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916571  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3638  cell division protein, FtsL -like  48.96 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0174  cell division protein FtsL  61.18 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.812847  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0160  cell division protein FtsL  60 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.484337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3505  cell division protein, FtsL -like  41.46 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0762  cell division protein FtsL  36.9 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2276  cell division protein, FtsL -like protein  32.93 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.373522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2987  cell division protein FtsL  35.11 
 
 
100 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3677  cell division protein FtsL  35.11 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.67489  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2501  cell division protein, FtsL-like  49.15 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.773445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3434  cell division protein FtsL  38.36 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2200  cell division protein FtsL  32.86 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.469837  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0112  cell division protein FtsL  42.86 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0603763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0515  cell division protein FtsL  36 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0596  cell division protein FtsL  31.43 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.852855  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0213  cell division protein FtsL  35.62 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0392  cell division protein FtsL  35.62 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.217545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04373  cell division protein FtsL  35.06 
 
 
87 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1463  cell division protein FtsL  35.14 
 
 
94 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3432  cell division protein, FtsL -like  33.72 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0814  cell division protein FtsL  35.71 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  0.80895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0455  putative cell division ftsL transmembrane protein  33.73 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.706499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2208  cell division protein FtsL  31.4 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.203384  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1975  cell division protein FtsL  34.29 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2054  cell division protein  34.29 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.81614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1068  cell division protein, FtsL -like  35.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175772  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3424  cell division protein FtsL  35.29 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494139  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0912  cell division protein FtsL  32.88 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4563  cell division protein FtsL  35.71 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0641  cell division protein FtsL  32.39 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03265  cell division protein FtsL  29.17 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0114313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1986  cell division protein FtsL  28.77 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0603  cell division protein FtsL  32.39 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2197  cell division protein, FtsL -like protein  34.85 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3394  cell division protein FtsL  30.99 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2925  cell division protein FtsL  30.99 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3525  cell division protein FtsL  30.99 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.100792  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2868  cell division protein, FtsL -like  32.84 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3599  cell division protein FtsL  30.56 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3787  cell division protein FtsL  30.56 
 
 
105 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>