32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3102 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2954  putative lipoprotein  61.93 
 
 		 193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.818118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3063  hypothetical protein  47.53 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2653  hypothetical protein  47.53 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00481564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2818  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0124705  normal  0.224694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0511  putative lipoprotein  39.36 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31977  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2798  hypothetical protein  46.92 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0555  hypothetical protein  44.53 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00222948  hitchhiker  0.00153836 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0585  hypothetical protein  45.26 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0945656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0488  hypothetical protein  45.38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.380914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0103  hypothetical protein  45.26 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3445  hypothetical protein  37.77 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00424122  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0513  hypothetical protein  45.38 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3670  hypothetical protein  44.53 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2648  CNP1-like protein of unknown function  46.46 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2519  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0879276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3263  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3522  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3485  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1300  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0441  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3520  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.214963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1144  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443664  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0198  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1119  putative lipoprotein  39.86 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.195336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0646  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 173 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000213359  normal  0.146411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1229  hypothetical protein  42.42 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000243549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1844  putative lipoprotein  37.41 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0351811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0835  hypothetical protein  35.54 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0747  hypothetical protein  31.65 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4214  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1272  hypothetical protein  27.14 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0527391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>