18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2827 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2827  putative TraY/DotA-like type IV secretion system protein  100 
 
 		 751 aa  1534    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0988  hypothetical protein  29 
 
 		 770 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3946  hypothetical protein  26.54 
 
 		 972 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5350  hypothetical protein  26.3 
 
 		 960 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2064  integral membrane protein  26.82 
 
 		 653 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0863025  normal  0.971709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1097  hypothetical protein  24.12 
 
 		 842 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.361233  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0084  integral membrane protein  24.23 
 
 		 722 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.421711  normal  0.537014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0348  DotA  23.39 
 
 		 814 aa  160  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1846  DotA protein  23.22 
 
 		 806 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1685  hypothetical protein  23.87 
 
 		 665 aa  156  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155635  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0064  traY protein  23.01 
 
 		 714 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0069  traY protein  23.37 
 
 		 714 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5612  hypothetical protein  23.83 
 
 		 752 aa  144  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.167609 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3854  hypothetical protein  25.17 
 
 		 776 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2740  defect in organelle trafficking protein DotA  26.62 
 
 		 1035 aa  134  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2613  defect in organelle trafficking protein DotA  36.23 
 
 		 1047 aa  121  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0097  type IV secretion system protein DotA-like protein  33.72 
 
 		 840 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551932  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4275  hypothetical protein  27.13 
 
 		 880 aa  71.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>