25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1785 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 		 90 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  87.64 
 
 		 90 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  70.59 
 
 		 96 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  72.62 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  59.77 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  61.63 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.32 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.47 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.65 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.47 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.47 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  55.95 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.47 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.14 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.12 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.22 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  52.33 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  50 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.1 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.1 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.1 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  38.16 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  38.24 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  29.27 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.26 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>