49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1778 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3096  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.49 
 
 		 120 aa  201  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0517504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2420  hypothetical protein  70.25 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3509  glyoxalase family protein  69.42 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.42 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1751  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1171  hypothetical protein  64.96 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1362  hypothetical protein  68.75 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  64.17 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1523  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.41 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216178  normal  0.435654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.13 
 
 		 178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.13 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.93 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3863  hypothetical protein  58.93 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.525519  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1344  hypothetical protein  53.98 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  55.83 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.55 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3164  hypothetical protein  50.45 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3509  hypothetical protein  50.45 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3254  hypothetical protein  50.45 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00230166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.55 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1370  hypothetical protein  53.1 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3227  hypothetical protein  51.35 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000491424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1508  hypothetical protein  53.1 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3161  hypothetical protein  49.55 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  50.88 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.57 
 
 		 174 aa  120  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.33 
 
 		 193 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1019  glyoxalase family protein  45.76 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5790  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.31 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.49 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.24 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.98 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3048  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.2 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1026  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.054762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0259  glyoxalase family protein  55.36 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0648  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.494314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16350  hypothetical protein  30.7 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4569  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3033  hypothetical protein  40.43 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0801  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.48 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21190  lactoylglutathione lyase family protein  28.85 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0790375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2267  hypothetical protein  58.62 
 
 		 50 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4070  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18940  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  36.45 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.700145  normal  0.302884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>