14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2532 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2532  Peptide chain release factor 1 (eRF1)-like protein  100 
 
 		 405 aa  815    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.023153  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  24.54 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0601  hypothetical protein  24.8 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4445  hypothetical protein  23.4 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0918  hypothetical protein  23.76 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3445  hypothetical protein  27.62 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1331  hypothetical protein  25.23 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.252381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1222  hypothetical protein  30.77 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4458  hypothetical protein  24.44 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2929  hypothetical protein  28.48 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.652299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0402  hypothetical protein  22.6 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4439  hypothetical protein  24.32 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6751  hypothetical protein  23.21 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151954 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  28.37 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>