10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7066 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7066  Arc domain protein DNA binding domain protein  100 
 
 		 90 aa  182  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000570212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1717  Arc domain-containing protein  52.27 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000298141  unclonable  0.0000000100109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51750  hypothetical protein  38.16 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3402  Arc domain-containing protein  41.51 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000582417  unclonable  1.23131e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3401  Arc domain-containing protein  54.05 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000104471  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2124  Arc domain-containing protein  44.19 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1200  Arc domain-containing protein  37.21 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0652  Mnt  35.29 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.778428 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3774  Arc domain-containing protein  33.9 
 
 		 99 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331674  unclonable  0.0000139531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20290  DNA binding-protein  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0669887  normal  0.454428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>