14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6300 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3946  radical SAM domain-containing protein  73.3 
 
 		 537 aa  825    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.488647  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6300  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 543 aa  1125    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0301  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 		 537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3150  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.27 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.5 
 
 		 524 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0043  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 447 aa  47.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.970198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.95 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0043  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 447 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0628937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  22.91 
 
 		 721 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 522 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 600 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0505  hypothetical protein  32.94 
 
 		 166 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 516 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>