28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5249 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
348 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  91.38 
 
 
348 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0372  flagellar hook-associated protein FlgL  62.57 
 
 
350 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0340  flagellar hook-associated protein FlgL  62.86 
 
 
350 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112309  normal  0.583206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  39.94 
 
 
355 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0278  flagellar hook-associated protein FlgL  40.79 
 
 
350 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  35.21 
 
 
349 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 
350 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  33.43 
 
 
344 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  33.9 
 
 
350 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  31.73 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  31.73 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  34.08 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  32.01 
 
 
348 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  33.93 
 
 
348 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  32.86 
 
 
347 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  30.73 
 
 
360 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1705  flagellar hook-associated protein FlgL  29.49 
 
 
351 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.173366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  30.68 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  24.56 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  25.47 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  27.61 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  27.84 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  23.51 
 
 
339 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  33.07 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  22.75 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  30.15 
 
 
597 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  33.33 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>