21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4191 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  68.13 
 
 
476 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  57.02 
 
 
479 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  57.02 
 
 
479 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  57.11 
 
 
479 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  53.68 
 
 
512 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  53.04 
 
 
505 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  50.21 
 
 
480 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  36.12 
 
 
474 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  34.1 
 
 
480 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  39.09 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  36.16 
 
 
513 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  36.29 
 
 
513 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  36.73 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  33.33 
 
 
503 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  27.87 
 
 
468 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  23.22 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  27.19 
 
 
466 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  27.19 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  32.97 
 
 
120 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  25.6 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>