18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2590 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
121 aa  239  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  83.87 
 
 
123 aa  199  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  72.41 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  76.77 
 
 
115 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  62.07 
 
 
124 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  66 
 
 
109 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  64.04 
 
 
121 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  59.83 
 
 
117 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  66.33 
 
 
110 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  71.72 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  58.72 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  61.76 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  58.82 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  58.82 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  64.71 
 
 
128 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  55.56 
 
 
113 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  55.56 
 
 
113 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  52.38 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>