12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2468 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2468  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  336  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3908  hypothetical protein  60.25 
 
 
161 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3238  hypothetical protein  55.13 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  23.3 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  31.37 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4518  hypothetical protein  28 
 
 
200 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4485  hypothetical protein  27.2 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  28.12 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  27.55 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  27.68 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  28.43 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1467  hypothetical protein  27.21 
 
 
191 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>