27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5765 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5765    100 
 
 		 411 bp  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  normal  0.53939 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  92.13 
 
 		 930 bp  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5058    91.89 
 
 		 585 bp  496  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  91.08 
 
 		 930 bp  486  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  91.08 
 
 		 930 bp  486  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  91.08 
 
 		 930 bp  486  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  87 
 
 		 930 bp  359  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  86.81 
 
 		 930 bp  355  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  86.81 
 
 		 930 bp  355  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  86.81 
 
 		 1128 bp  355  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  86.54 
 
 		 930 bp  347  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    86.54 
 
 		 1992 bp  347  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  83.71 
 
 		 708 bp  153  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7887    85.37 
 
 		 637 bp  101  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  87.23 
 
 		 570 bp  91.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  85.86 
 
 		 921 bp  85.7  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1212    80.99 
 
 		 555 bp  67.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129542  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6207    86.57 
 
 		 335 bp  61.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  82.61 
 
 		 873 bp  56  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3888    89.36 
 
 		 955 bp  54  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3869    89.36 
 
 		 982 bp  54  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  87.76 
 
 		 714 bp  50.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  87.76 
 
 		 714 bp  50.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  87.76 
 
 		 714 bp  50.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5450    93.94 
 
 		 789 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0734  IS511, transposase OrfB  100 
 
 		 243 bp  50.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.036087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  87.76 
 
 		 714 bp  50.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>