35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0487 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0487  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0238361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0531  hypothetical protein  97.44 
 
 
81 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0900  hypothetical protein  84.62 
 
 
78 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.549897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0213  hypothetical protein  78.95 
 
 
83 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0193  hypothetical protein  78.95 
 
 
83 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3044  hypothetical protein  77.63 
 
 
83 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0423  hypothetical protein  73.08 
 
 
78 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0436  hypothetical protein  73.33 
 
 
83 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1348  hypothetical protein  69.74 
 
 
82 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0440687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4110  hypothetical protein  71.62 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1484  hypothetical protein  72.37 
 
 
81 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0905303  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1854  hypothetical protein  72.22 
 
 
81 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0677881  decreased coverage  0.000466898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3874  hypothetical protein  70.67 
 
 
75 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21436  normal  0.053171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4184  hypothetical protein  70.67 
 
 
75 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.948994  normal  0.7469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6073  hypothetical protein  71.62 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6609  hypothetical protein  68.92 
 
 
82 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.642327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4331  hypothetical protein  69.33 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.014521  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1488  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4706  hypothetical protein  65.28 
 
 
80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3180  hypothetical protein  64 
 
 
83 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.609523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0629  hypothetical protein  69.01 
 
 
79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0071  hypothetical protein  59.42 
 
 
87 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162913 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2558  hypothetical protein  60 
 
 
83 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15069  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0058  hypothetical protein  61.97 
 
 
81 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0111  hypothetical protein  60.56 
 
 
81 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1460  hypothetical protein  60.56 
 
 
81 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4536  hypothetical protein  60.87 
 
 
74 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.178534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0916  hypothetical protein  61.97 
 
 
82 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0638  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.217118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1689  hypothetical protein  65.82 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0401  hypothetical protein  59.7 
 
 
108 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44259  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2228  hypothetical protein  59.7 
 
 
73 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0518  hypothetical protein  53.03 
 
 
71 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1206  hypothetical protein  53.42 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.827802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0441  hypothetical protein  48.48 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>