29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4474 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.3 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3699  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  34 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0618  hypothetical protein  34.69 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4289  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.07 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3592  hypothetical protein  32.22 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3883  hypothetical protein  29.85 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4415  hypothetical protein  32.22 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0571  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.240779  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3112  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4067  hypothetical protein  31.4 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0208636  normal  0.9668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3337  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4180  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4186  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48428  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2365  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.59 
 
 		 174 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000368408  hitchhiker  0.000000322057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1532  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.76 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.67 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0995  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588221  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1329  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1826  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437082  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0267  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0372  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0329059  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0300  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1741  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>