53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3978 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3978  acyl carrier protein  100 
 
 		 90 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3384  phosphopantetheine-binding  60.49 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2373  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0279072  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2109  acyl carrier protein  47.67 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  39.39 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3875  acyl carrier protein, putative  37.65 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6845  acyl-carrier protein  29.41 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  30.12 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4368  acyl carrier protein, putative  31.4 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  36.47 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3676  acyl carrier protein, putative  31.4 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  34.57 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0350  acyl carrier protein, putative  31.4 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0350  acyl carrier protein, putative  32.14 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0342  acyl carrier protein, putative  32.14 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0340  acyl carrier protein, putative  32.14 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0347  acyl carrier protein, putative  32.14 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  35.29 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0446  acyl carrier protein, putative  32.14 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0344  acyl carrier protein, putative  31.4 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2103  putative acyl carrier protein  34.12 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5802  acyl carrier protein  32.31 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804663  normal  0.487343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  37.65 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0438  phosphopantetheine-binding protein  40.35 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0477686  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03870  acyl-carrier protein-like protein  30.12 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004064  acyl carrier protein  31.71 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  32.05 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  34.94 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  37.1 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0797  acyl carrier protein, putative  32.91 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  34.21 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0940  acyl carrier protein  32.91 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.923703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3511  acyl carrier protein, putative  29.76 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0728445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4378  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00196249  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1993  acyl carrier protein  33.73 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.275282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  36.25 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1089  hypothetical protein  27.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1379  acyl carrier protein  29.41 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.1236  hitchhiker  0.00487653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2759  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2145  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  32.53 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  30 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00794  putative acyl-carrier-protein  31.76 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2116  acyl carrier protein  29.87 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4596  hypothetical protein  28.57 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6089  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0325  acyl carrier protein, putative  27.91 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  28.89 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1488  acyl carrier protein  43.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2678  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2811  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>